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HLA-DRB1基因芯片与PCR-SSP分型的比较


□ 肖家全等

  [摘要] 目的 比较基因芯片和PCI(—SSP用于汉族南方人群HLA-DRBl基因分型的结果,评价分型芯片的准确性。方法 77份待分型样本,分别用等位基因特异的PCR-SSP和基因分型芯片对DRBl分型。芯片分型通过组间特异引物扩增基因组DNA,扩增中用荧光标记。扩增标记后的产物与分型芯片的探针杂交,通过杂交产生的荧光信号确定样品的HLA-DRN1基因亚型,比较两种方法分型所获得的结果,不吻合的样本全部经第三方验证或测序。结果 77份样本,两种方法分型全部成功。分型结果的吻合率为93%。不吻合样本6份,其中SSP定型纯合子4份,芯片分型全部为杂合子。经第三方验证,证实芯片对纯合子和杂合子的分型全部正确。另外2份不吻合的样本经测序,证实SSP分型错误1份,芯片分型错误1份。芯片的重复率为96%。结论 基因芯片是一种理想的分型方法,具有特异性高、重复性好、操作简便、所需样本量少、一次可作多份样本的优点。
  [关键词] 人类白细胞抗原—DRN1; 基因芯片; 顺序特异引物聚合酶链反应; 基因分型
  [中国图书馆分类法分类号] Q754

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