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基于功能模块的基因表达谱聚类分析


□ 郭 政 张田文 王 琦 王海芸

  摘要:按Gene Ontology基因功能分类体系,将基因模块化地组织成个有显著生物意义的低维功能模块单元,交将其作为新的分析指标用于分类微阵列疾病样本,从而提出了基于功能表达谱的聚类分析新途径。采用NC160数据集,通过功能表达谱对组织样本进行聚类分析。结果显示,新算法不但得到高准确度的样本分型结果,而且能够直接从功能水平上给出相应的生物学解释。同时,用基于功能表达谱对组织样本进行聚类分析可以显著降低特征维数,有效地处理高检测误差与基因表达变异问题。
  关键词:基因表达谱;功能表达谱;基因功能分类体系;聚类
  中图分类号:Q344.13;TP391.4
  文献标识码:A
  文章编号:0253-374X(2006)02-0264-06

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