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基于生物信息学的结核杆菌候选药靶基因的分析筛选


□ 赖煦卉 毕安定 王洪海

  摘 要:结核分支杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)是结核病致病菌,MTB基因组和蛋白质组的研究为筛选新的抗MTB药物提供了可能。鉴于前人所做的工作,目前比较一致的意见是:与MTB细胞壁的全成相关的酶类,尤其是与脂肪酸合成和降解相关的酶类,是筛选抗结核杆菌药物的理想靶标。选取与脂肪酸合成、分解、转动相关的187个基因,分析blast结果,剔除与人和其他生物(如大肠杆菌等)蛋白序列相似性大于60%的基因。利用相关生物软件挑选出至少有一个糖基位点且具有溶剂可及性的抗原基因9个。本研究为以后分析药靶基因编码蛋白质的三维结构、利用现有的生物技术和有关的化合物对候选药靶进行功能研究、在细胞水平加以验证打下基础。
  关键词:生物信息学;结核分支杆菌;脂肪酸;药靶基因
  中图分类号:Q933
  文献标识码:A
  文章编号:0427-7104(2004)06-1051-05

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